颜色编码DNA承诺更便宜的测序

时间:2017-10-05 01:01:28166网络整理admin

作者:Celeste Biever与传统方法相比,用于激光测序的颜色编码DNA的新技术可以提供更快,更便宜的基因组测序方法通过将DNA的四个构建块中的每一个染成不同的颜色,人类基因组的一小部分已经由化学工程师Jingyue Ju和他在美国纽约哥伦比亚大学的同事测序通过更多的工作,该技术可以用于并行地对数百万个较长的DNA链进行测序,从而大大降低了对整个哺乳动物基因组进行测序的成本该研究小组将染料添加到普通的DNA构建模块中,称为核苷酸,根据其中的四个DNA碱基 - 腺嘌呤,鸟嘌呤,胞嘧啶和胸腺嘧啶 - 所含的核苷酸然后,他们从人类p53基因中诱导出一条12碱基的DNA链,从修饰的核苷酸中构建出自身的互补拷贝由此产生的DNA链编码原始的12碱基链,但与原始DNA不同,可以很容易地测序,因为它颜色鲜艳传统上,使用称为毛细管阵列电泳(CAE)的技术进行DNA测序,该技术使用非常复杂的软件将DNA链分解成数百万个不同的片段,然后再将它们拼接在一起它运行良好,但需要更快,更便宜的方法,因为一次最多可以对384条链进行测序,该技术需要昂贵的设备和试剂美国马里兰州贝塞斯达市国家人类基因组研究所(NHGRI)的Jeff Schloss表示,“我们已经将CAE降低了大部分成本”该公司为Ju的工作提供资金支持一种可商购的替代品是焦磷酸测序,当它们被添加到单链DNA中时也检测核苷酸,但是它可能导致错误,因为难以区分单个碱基和彼此相邻的整个相同碱基段,美国圣路易斯华盛顿大学的遗传学家伊莱恩·马迪斯说相比之下,Ju的修饰核苷酸含有阻断剂,确保一次只能测量一个碱基,即使存在一整段相同的碱基一旦检测到并记录了其颜色,就用激光将染料和阻断剂切除,允许添加下一个核苷酸美国剑桥麻省理工学院的遗传学家Chad Nusbaum说:“这篇论文代表了一个令人兴奋的,令人印象深刻的原理证明,是通往真正廉价基因组测序的重要早期步骤之一”通过资助这项工作,NHGRI希望在未来10年内将哺乳动物大小的基因组测序成本从1000万美元降至1000美元 - 这足以让患者在接受基因组定制治疗之前对基因组进行测序期刊参考: